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Freelance Bioinformatician & Biomedical Scientist | Consulting, Research, Service | Biomedicine meets data science

zuletzt online vor wenigen Stunden
  • 120‐150€/Stunde
  • Hamburg
  • auf Anfrage
  • de  |  en
  • 21.11.2024

Kurzvorstellung

Data is the future of biomedicine, and I contribute to discovery and innovation with the analysis and interpretation of large biomedical datasets. My main focus is on omics technologies in immunology, neuroscience and developmental biology.

Qualifikationen

  • Big Data2 J.
  • bioinformatics
  • Bioinformatik
  • Biologie7 J.
  • Biomedizin
  • computational biology
  • Data Science7 J.
  • Proteomik
  • Sequenzierung
  • single cell
  • Transkriptomik

Projekt‐ & Berufserfahrung

Freelance Bioinformatician
Self-employed, Hamburg
10/2023 – offen (1 Jahr, 2 Monate)
Life Sciences
Tätigkeitszeitraum

10/2023 – offen

Tätigkeitsbeschreibung

Biomedical data analysis & interpretation
- Transcriptomics: Gene expression (spatial, single-cell, bulk), Non-coding RNA
- Epigenomics: Chromatin accessibility (ATAC), DNA-protein interactions (ChIP)
- Proteomics: Mass spectrometry, High-dimensional flow cytometry / Mass cytometry
- Immunomics: T/B cell receptor repertoire, Cytokine profiling
- Integration of multiple omics approaches on single-cell and bulk level

Bioinformatics consulting
- Implementing next-generation sequencing technologies
- Planning of omics projects
- Consulting & training for bioinformatic data analysis

Eingesetzte Qualifikationen

Biologie, Data Science

Team Lead and Senior Research Associate Bioinformatics (Festanstellung)
University Medical Center Hamburg-Eppendorf, Hamburg
6/2022 – 10/2024 (2 Jahre, 5 Monate)
Life Sciences
Tätigkeitszeitraum

6/2022 – 10/2024

Tätigkeitsbeschreibung

- Developing novel computational pipelines for proteomic data analysis
- Analysing and interpreting various omics datasets
- Technologies: multiomics (single-cell and bulk mRNA & ATAC sequencing), high-dimensional flow cytometry

Eingesetzte Qualifikationen

Big Data, Biologie, Data Science

Research Associate Bioinformatics (Festanstellung)
Leibniz Institute of Virology, Hamburg
6/2022 – 10/2023 (1 Jahr, 5 Monate)
Life Sciences
Tätigkeitszeitraum

6/2022 – 10/2023

Tätigkeitsbeschreibung

- Teaching a bioinformatics course
- Implementing next-generation sequencing protocols and pipelines
- Managing omics applications in multiple projects within the research group

Eingesetzte Qualifikationen

Biologie, Data Science

Doctoral Researcher (Festanstellung)
University Medical Center Groningen, Hamburg
9/2016 – 6/2021 (4 Jahre, 10 Monate)
Life Sciences
Tätigkeitszeitraum

9/2016 – 6/2021

Tätigkeitsbeschreibung

- Generating next-generation sequencing libraries
- Applying computational algorithms for omics data analysis
- Supervising 4 Master and 1 Doctoral student
- Presenting results at (inter)national conferences and in publications

Eingesetzte Qualifikationen

Biologie, Data Science

Über mich

I have 5+ years of experience in bioinformatics, biomedical research and experimental generation of omics data. As a result of my mixed background in computational- and molecular biology, I know where the data comes from and what it means.

Persönliche Daten

Sprache
  • Deutsch (Muttersprache)
  • Englisch (Fließend)
Reisebereitschaft
auf Anfrage
Arbeitserlaubnis
  • Europäische Union
Home-Office
bevorzugt
Profilaufrufe
216
Berufserfahrung
8 Jahre und 2 Monate (seit 09/2016)
Projektleitung
1 Jahr

Kontaktdaten

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