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Software Developer und Data Scientist

offline
  • auf Anfrage
  • 70174 Stuttgart
  • DACH-Region
  • de  |  en
  • 22.03.2023

Kurzvorstellung

Python, R, Java, C++, TensorFlow, Keras, Docker, Ansible, Kubernetes

Qualifikationen

  • Ansible
  • Apache Spark
  • C++3 J.
  • DevOps
  • Docker5 J.
  • HTML3 J.
  • Java (allg.)
  • JavaScript3 J.
  • Kubernetes3 J.
  • Python6 J.

Projekt‐ & Berufserfahrung

software developer
Genentech, San Francisco
9/2022 – 3/2023 (7 Monate)
IT & Entwicklung
Tätigkeitszeitraum

9/2022 – 3/2023

Tätigkeitsbeschreibung

metaproteomics analysis pipeline

Eingesetzte Qualifikationen

Mongodb, Docker, Python

software developer
Sick AG, Waldkirch, Waldkirch
6/2022 – 8/2022 (3 Monate)
Logistikdienstleister
Tätigkeitszeitraum

6/2022 – 8/2022

Tätigkeitsbeschreibung

Python backend development, MongoDB

Eingesetzte Qualifikationen

Python

Technical Lead
European Central Bank, Telekom Systems Internation, Freiburg
11/2021 – 4/2022 (6 Monate)
Banken
Tätigkeitszeitraum

11/2021 – 4/2022

Tätigkeitsbeschreibung

Technical Lead. Time series analysis, quality control and reporting using Python, R and Shiny.

Eingesetzte Qualifikationen

Python

software developer
Coaching Center Berlin, Freiburg
7/2021 – offen (3 Jahre, 6 Monate)
Dienstleistungsbranchen (Service)
Tätigkeitszeitraum

7/2021 – offen

Tätigkeitsbeschreibung

Erweiterung eines Umfrage Portals

Eingesetzte Qualifikationen

Docker, HTML, JavaScript, Kubernetes, Python

Software Entwickler
MOBILion Inc., Philadelphia
8/2020 – 1/2021 (6 Monate)
Life Sciences
Tätigkeitszeitraum

8/2020 – 1/2021

Tätigkeitsbeschreibung

Quantifizierung von bekannten Peptiden in Ion Mobility Daten mit Hilfe von OpenMS und Python Wrapper pyOpenMS

Eingesetzte Qualifikationen

Latex, Python, XML

Software Entwickler
Universität Freiburg, Freiburg
6/2017 – 7/2019 (2 Jahre, 2 Monate)
Hochschulen und Forschungseinrichtungen
Tätigkeitszeitraum

6/2017 – 7/2019

Tätigkeitsbeschreibung

Deep Learning Ansatz zur Peptid Detektion. Detektierung von Peptid Isotope Patterns in Massenspektrometrie Daten mit Hilfe von Convolutional Neural Networks (U-net, Ronneberger et al. 2015)

Eingesetzte Qualifikationen

Keras, Python, XML

Software Entwickler
Universität Freiburg, Freiburg
5/2017 – 9/2018 (1 Jahr, 5 Monate)
Hochschulen und Forschungseinrichtungen
Tätigkeitszeitraum

5/2017 – 9/2018

Tätigkeitsbeschreibung

Label Free Proteomik Workflow. Neuer Ansatz für Alignment und Linking für Plasma und Urin Proben, Batch Effect Removal und neue Quality Control Metrics

Eingesetzte Qualifikationen

C++, KNIME

Software Entwickler
Universität Freiburg, Freiburg
3/2017 – 3/2020 (3 Jahre, 1 Monat)
Hochschulen und Forschungseinrichtungen
Tätigkeitszeitraum

3/2017 – 3/2020

Tätigkeitsbeschreibung

Quality Control Skripte für Proteomik Workflows. R Library für Postprocessing und Quality Control von Proteomik Daten, Quality Control Reports für gängige Methoden (SILAC, Label Free, TMT, iTRAQ)

Eingesetzte Qualifikationen

Latex

Software Entwickler
Universität Freiburg, Freiburg
8/2016 – 4/2018 (1 Jahr, 9 Monate)
Hochschulen und Forschungseinrichtungen
Tätigkeitszeitraum

8/2016 – 4/2018

Tätigkeitsbeschreibung

Virtual Tissue Dissection. Zell-Typ Identifizierung in Gewebeproben durch Deep Peptide Fingerprinting und PCA.

Eingesetzte Qualifikationen

C++

Software Entwickler
Roche AG, Basel
8/2016 – 2/2018 (1 Jahr, 7 Monate)
Life Sciences
Tätigkeitszeitraum

8/2016 – 2/2018

Tätigkeitsbeschreibung

Pilot Studie für Roche pRED. Evaluation von OpenMS Proteomik Workflows für Roche AG, Vergleichsstudie verschiedener Search Engines (Peaks, Novor, MS-GF+), Deployment auf Roche HPC Cluster mit Hilfe von Docker

Eingesetzte Qualifikationen

C++, Docker

Software Entwickler
Universität Freiburg, Freiburg
6/2015 – 2/2018 (2 Jahre, 9 Monate)
Hochschulen und Forschungseinrichtungen
Tätigkeitszeitraum

6/2015 – 2/2018

Tätigkeitsbeschreibung

Deep Proteomik. Identifizierung von ultra-low-abundance Peptiden in Protein Proben, Kombination aus Shotgun und Targeted Fragmentierungsmethoden.

Eingesetzte Qualifikationen

C++

Ausbildung

Physik
PhD
2005
Manchester
Physik
Diplom
2000
Heidelberg
Physik
MSci
1997
Durham

Über mich

Ausbildung in Theoretischer Elementarteilchen Physik. 10+ Jahre Erfahrung in Bioinformatik mit Schwerpunkt Proteomik. DevOps Erfahrung mit Ansible und Kubernetes.

Weitere Kenntnisse

Software Entwicklung und DevOps Projekte

Persönliche Daten

Sprache
  • Deutsch (Muttersprache)
  • Englisch (Fließend)
Reisebereitschaft
DACH-Region
Arbeitserlaubnis
  • Europäische Union
  • Schweiz
Home-Office
bevorzugt
Profilaufrufe
1136
Alter
51
Berufserfahrung
19 Jahre und 1 Monat (seit 11/2005)

Kontaktdaten

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