Datenanalyse und Softwareimplementierung
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- 31.10.2018
Kurzvorstellung
Datenanalyse (u.a. multi-omics Daten), R-Programmierung, Projektmanagement, Implementierung und Einführung von Softwarelösungen
Qualifikationen
Projekt‐ & Berufserfahrung
3/2014 – 6/2014
Tätigkeitsbeschreibung
Spotfire Programmierung
Erfassung und Dokumentation der Nutzeranforderungen
Integration von unterschiedlichen Daten (aus Datenfiles oder Datenbanken via SQL)
Datenkomprimierung und Datenvisualisierung (Listen, Ausgabe statistischer Werte, graphische Visualisierung wie Line-/Pie-/Barcharts, geogrphsiche Karten)
Datenanalysen: allgemeine statistische Auswertung
Aufarbeitung der Daten für die Darstellung via Webplayer
Präsentation von Projektergebnissen
Schulung in der Nutzung von TIBCO Spotfire
Spotfire, SQL, Statistiken
1/2014 – 12/2017
Tätigkeitsbeschreibung
Entwicklung und Implementierung eines Datenmanagementsystem für die Pflanzenzüchtung:
Projektmanagement
Erfassung und Dokumentation von Nutzeranforderungen, Pflichtenhefte
Koordinierung zwischen Kunde und Softwareentwickler
Einführung der entwickelten Systeme beim Kunden (Nutzerschulungen, allgemeiner Support)
Nutzerspezifische Erweiterung der Software auf basis von R
R (Programmiersprache), Postgresql, Projektmanagement (IT), Rollout, Agrartechnik, Statistiken, Data Science
2/2006 – 10/2011
Tätigkeitsbeschreibung
Aufbau und Leitung des Teams Bioinformatik
Projektleitung für verschiedene Projekte
Entwicklung und Einführung eines wissenschaftlichen Datenmanagement Systems
Ausarbeiten und Durchführung von Software-Schulungen
Präsentation der Ergebnisse der Arbeitsgruppe
Etablierung und Automatisierung von Methoden für die Analyse von genomweiten Genexpressionsdaten, anderen `omics Daten und Sequenzdaten Daten aus Human- und Mausstudien
Entwicklung und Etablierung einer Software für die Modellierung von biologische Netzwerken
Arbeiten in einem internationalen, Standort-übergreifendem und englisch-sprachigem Team
R (Programmiersprache), Spotfire, Predictive Analytics, Data Mining, Reporting, User Experience (UX), Softwareauswahl (Evaluierung)
Ausbildung
Giessen
Weitere Kenntnisse
• Erfassung und Dokumentation der Nutzeranforderungen
• Definition von Use Cases
• Entwicklung und Implementierung von Analyseverfahren (u.a. Datennormalisierung, Regressionen, statistische Tests, Clusterverfahren, PCA, maschinelle Lernverfahren)
• Anwendung von Analyseverfahren auf diverse Datentypen
• Standardisierung und Dokumentation von Analyseverfahren
Entwicklung von Datenmanagement-/Softwarelösungen
• Erfassung und Dokumentation der Nutzeranforderungen
• Definition von Use Cases
• Entwicklung von (relationalen) Datenmodellen
• Entwicklung von Software-Prototypen (in Zusammenarbeit mit Informatikern)
• Iterative Umsetzung der Nutzeranforderungen
• Validierung und Integration von heterogenen Daten
• Integration von externen Analysetools, z.B. R
• Standardisierung und Dokumentation von Arbeitsabläufen
• Dokumentation und Präsentation von Projektergebnissen
• Nutzerschulungen
Software Evaluierung
• Erfassung und Dokumentation der Nutzeranforderungen
• Evaluierung möglicher Softwarelösungen
• Dokumentation der evaluierten Software, Darstellung der Vor- und Nachteile, Empfehlungen für einzelne Lösungen
• Einführung der Software mit Trainingseinheiten
Spotfire Programmierung/Reporting
• Erfassung und Dokumentation der Nutzeranforderungen
• Integration von unterschiedlichen Daten (aus Datenfiles oder Datenbanken)
• Datenkomprimierung und Datenvisualisierung (Listen, Ausgabe statistischer Werte, graphische Visualisierung wie Line-/Pie-/Barcharts, Box-/Scatterplots, Heatmaps, Dendrogramme)
• Datenanalysen: Korrelationsanalysen, Clustering, allgemeine statistische Auswertung
• Aufarbeitung der Daten für die Darstellung via Webplayer
• Präsentation von Projektergebnissen
• Schulung in der Nutzung von TIBCO Spotfire
R-Programmierung
• Erfassung und Dokumentation der Nutzeranforderungen
• Implementierung von Analyse-, Visualisierungs- und Reportingfunktionen
Evaluierung öffentlich verfügbarer Daten
• Erfassung der internen Fragestellungen
• Datenbankrecherchen
• Zusammenstellung von relevanten Datenquellen oder einzelnen Datensätzen
• Integration proprietärer und öffentlich verfügbarer Daten
• Dokumentation der Ergebnisse
EDV-Kenntnisse
• R/Bioconductor: sehr gute Kenntnisse
• Analyse und Reporting Software wie Tibco Spotfire: sehr gute Kenntnisse
• Programme zur Analyse und Interpretation von multi-omics und SNP Daten: u.a. Tibco Spotfire, EMBOSS, Flapjack: sehr gute Kenntnisse
• Programme für die Modellierung biologischer und chemischer Netzwerke: Ingenuity Pathway Analysis, Genstruct Technology Platform, Cytoscape: sehr gute Kenntnisse
• Gen- und Protein-basierte Datenbanken: u.a. NCBI- und EBI-Datenbanken: sehr gute Kenntnisse
• KNIME/RapidMiner: Grundlagen Kenntnisse
• PERL Programmierung: gute Kenntnisse
• Linux/Unix Betriebssystem: gute Kenntnisse
• SQL: gute Kenntnisse
• Microsoft: MS Word, MS Excel, MS Powerpoint, MS Access: sehr gute Kenntnisse
Persönliche Daten
- Deutsch (Muttersprache)
- Englisch (Fließend)
- Europäische Union
Kontaktdaten
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